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惠比特猎犬的快速基因组分析为生物多样性研究树立了新标准

2024-10-24 14:37:13 生活 来源:
导读 全球生物多样性的持续丧失使得快速收集和分析濒危物种的遗传信息变得越来越必要。在一个联合项目中,位于莱茵河畔因格尔海姆的 Bioscienti...

全球生物多样性的持续丧失使得快速收集和分析濒危物种的遗传信息变得越来越必要。在一个联合项目中,位于莱茵河畔因格尔海姆的 Bioscientia 医学诊断研究所人类遗传学系和位于法兰克福的 LOEWE 转化生物多样性基因组学中心 (LOEWE-TBG) 在不到一周的时间内对惠比特猎犬的完整基因组进行了测序和分析。

这一进展可能对物种基因组研究和生物多样性保护产生持久影响。该研究已发表在《GigaByte》杂志上。

惠比特犬基因组的分析采用了一项新技术:整个基因组的测序非常精确,并且以长片段的形式进行,即所谓的长读长。以速度最快的陆地动物之一惠比特犬为例,这一成果在创纪录的时间内实现。这不仅是技术上的成功,也是作为应对物种灭绝挑战的标志性项目而发起的。

Bioscientia 人类遗传学负责人 Hanno Bolz 教授解释说:“我们证明,我们可以在几天内(而不是几个月)获得并分析完整的基因组信息。” Bioscientia 人类遗传学家与 LOEWE Center TBG 研究人员之间的新合作树立了新标准,并为生物多样性研究提供了有效的工具。

快速分析对于濒危物种的保护越来越重要,因为面对生物多样性的迅速丧失,时间至关重要。“通过这样的项目,我们可以快速提供有关濒危物种的重要遗传信息。这不仅有助于我们了解它们的进化适应性,而且还有助于制定有针对性的保护措施,”LOEWE 中心 TBG 实验室负责人 Carola Greve 博士说。

除了惠比特犬项目外,两家研究伙伴的另一项关于濒危花园睡鼠的联合研究也将很快发表。其他几个联合测序项目也已在进行中。

在生物科学研究所人类遗传学系,大约有 100 名专家每年分析数千个基因组以及基因组的蛋白质编码区域(称为外显子组),以确定来自世界各地的患者罕见遗传病的原因。

Bioscientia 是首个将猎犬研究中采用的创新型“长读”基因组测序方法应用于人类基因诊断的实验室。这将使人类更有效地识别遗传疾病成为可能,并有可能显著改善治疗方案。

位于德国法兰克福森肯伯格自然研究学会的 LOEWE 中心 TBG 的科学家正在对从细菌到鲸鱼等许多非人类生物的基因组进行测序。这些信息提供了有关许多濒临灭绝的动植物的宝贵信息,以及对它们的生物关系、进化和对环境条件的适应性的见解。这有利于基础研究和应用研究,包括保护管理。


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