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帕金森病研究开发分析流程以识别未开发的基因

2024-09-10 10:54:20 生活来源：

导读广岛大学的一个研究小组开发了一套分析流程，可以根据提供基因-疾病关联的五个数据库来识别特定疾病的未开发基因。他们利用该流程研究了氧...

广岛大学的一个研究小组开发了一套分析流程，可以根据提供基因-疾病关联的五个数据库来识别特定疾病的未开发基因。他们利用该流程研究了氧化应激及其相关疾病帕金森病，并将其作为案例研究。

他们的研究结果于 2024 年 8 月 17 日发表在《npj Parkinson's Disease》杂志上。

科学家可以通过数据库(例如 Open Targets Platform、DisGeNET、miRTex、RNADisease 和 PubChem)获取人类疾病相关基因数据。然而，由于管理错误、偏见和文本挖掘失败，这些数据库缺少一些数据条目。除了缺少条目之外，由于对人类疾病的研究非常广泛，登记综合数据也面临挑战。

科学家认识到数据库中缺少必要数据会对知识共享产生负面影响，需要加以解决。因此，研究团队提出了一种分析流程，用于探索人类疾病相关基因数据库中未开发基因的缺失条目。

广岛大学基因组信息学实验室和 Bio-DX 实验室的教授 Hidemasa Bono 表示：“我们提出了一种利用公共数据库探索与疾病相关的氧化应激相关的新候选基因的方法。”他们的方法分为三个主要部分。

在第 1 部分中，他们通过分析基因表达数据和参考转录组关联研究结果，确定了对帕金森病和氧化应激作出反应的基因。

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