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近年来,微生物组研究开始将重点从微生物本身转向它们产生的分子。毕竟,正是这些分子直接与人体细胞相互作用,影响人的健康。然而,试图确定人体微生物组正在产生哪些分子是相当具有挑战性的。典型的代谢组学研究只能表征人类微生物组样本中约 10% 的分子数据。
在《自然》杂志上发表的一项新研究中,加州大学圣地亚哥分校的微生物组专家首次推出了一种他们称之为“反向代谢组学”的新方法。该技术结合了有机合成、数据科学和质谱分析,以更好地了解微生物组分泌的分子以及它们如何影响人类健康。
在反向代谢组学的首次应用中,科学家们发现了数百种以前从未在人体中观察到的分子。利用这些新数据,他们能够识别炎症性肠病(IBD)的新代谢组学特征。作者表示,这些分子有朝一日可以作为诊断 IBD 的生物标志物,或作为帮助治疗该疾病的潜在治疗靶点。
“我们知道微生物群很重要,但我们不知道微生物会产生什么类型的分子,也不知道它们对人体的影响有多大,”资深作者、斯卡格斯学院教授 Pieter C. Dorrestein 博士说。加州大学圣地亚哥分校的药学和制药科学。“反向代谢组学帮助我们评估是否可以在样本中找到特定分子,预测哪些微生物正在产生它们,并将这些代谢组学特征与健康和疾病联系起来。”
在典型的代谢组学研究中,研究人员将使用一种称为质谱的工具来寻找样品中的不同分子。在这项技术中,每个分子都有自己的“条形码”,可以通过它来识别。尽管如此,科学家仍然需要知道这些条形码代表什么来描述样本的内容,这仍然是一个挑战。
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