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(Medical Xpress) — Mayo Clinic 的一组研究人员详细了解了一种称为 FOXA1 的转录因子如何形成癌症特异性基因组标识符,以及它如何在四种截然不同类型的人类癌细胞系中以不同方式调节基因表达。在《科学进展》杂志上发表的论文中,该团队描述了他们如何使用基因编辑技术和其他工具来更多地了解独特的结合过程,该过程允许蛋白质调节不同类型癌症中的基因表达。
科学家们知道,癌症并不是孤立生长的,肿瘤就像身体的其他部位一样,是由细胞组成的,这些细胞依赖于与其他组织或器官相同的生物过程来调节器官发生。其中一个过程是转录调节,细胞调节 DNA 序列向 RNA 的转换。在这项新的研究中,研究人员研究了蛋白质编码基因 FOXA1,该基因与多种类型的人类癌症有关。更具体地说,他们研究了如何仅一种转录因子就能够对不同类型的细胞形成癌症特异性基因组变化,因为这在试图了解肿瘤如何生长时很重要,而且迄今为止,它仍然不是很好理解。
研究人员从一种允许处理大量基因组的测序技术开始,这使他们能够了解 FOXA1 如何靶向两种不同类型的乳腺癌细胞以及肝癌和前列腺癌细胞中的基因,这使他们能够看到该蛋白质以前未知的特征;定制靶向并结合 DNA。随后,研究小组使用 CRISPR-Cas9 基因组编辑技术进行了更深入的研究,发现细胞特异性的 FOXA1 调控是由于独特的结合、遗传变异和/或可能的非基因调控,这增加了 FOXA1 控制这一过程的更多证据。特定类型的癌细胞形成。
在分析了他们的工作后,该团队提出了一个假设来描述他们认为这个过程是如何运作的,并将其描述为一个看起来很像花朵绽放时所发生的过程。他们认为,某些转录因子的“繁荣”可能是通过其遗传变异的独特性、其独特的结合能力以及可能包括其他调节因子和/或染色质重塑的其他可能因素来控制的。最终结果是关于癌细胞生长背后机制的更多信息,这增加了不断增长的数据量,有一天可能会揭示一种控制这种生长的方法,从而防止癌症造成伤害。
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