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科学家们利用基因组重建技术,识别出一种以前“看不见”的鱼类寄生虫,这种寄生虫存在于全球众多海洋鱼类中。这种寄生虫属于顶复虫,顶复虫是一类重要的临床寄生虫,在早期研究中被忽视了。它在全球各地和不同鱼类中广泛存在,这对商业和海洋食物链具有重要影响。
迈阿密大学罗森斯蒂尔海洋、大气和地球科学学院和西班牙国家研究委员会 (IC) 和庞培法布拉大学 (UPF) 合作中心进化生物学研究所 (IBE)的国际科学家团队在热带珊瑚鱼红唇鲽鱼中发现了一种新寄生虫。这项研究还揭示了这种寄生虫在全球鱼类种群中的全球分布情况。
该研究最近发表在《当代生物学》杂志上,采用一种创新方法,根据从寄主获得的测序数据重建了部分寄生虫基因组,并能够使用基因“条形码”(DNA条形码)检测其在其他鱼类中的存在。
一种“耳机 ”寄生虫被揭开
尽管这种寄生虫存在于世界各地的鱼类中,但直到现在才得到正确的鉴定。这项研究的基因组数据显示,这种寄生虫属于一组以前未鉴定的生物,并被命名为 ichthyocolids,源自拉丁语“鱼栖息者”。
“尽管之前已经通过显微镜识别了这种寄生虫,但直到现在我们才能够将基因组信号从寄主鱼和寄生虫中分离出来。这是我们第一次能够通过它们的 DNA 识别它们,并将它们归入众所周知的顶复门寄生虫群中,”这项研究的负责人、IBE 微生物生态学和进化小组和迈阿密罗森斯蒂尔学院的首席研究员 Javier del Campo 说。
这种寄生虫存在于世界各地的鱼类中
除了可以描述一组全新的顶复门生物之外,基因组重建还使研究人员能够识别一系列基因,这些基因可用于检测其他基因组或微生物组样本中这种生物的存在,就像“条形码”一样。
“当我们在热带鱼红唇鳚体内发现鱼鳞时,我们就想知道它是否也是其他鱼类微生物群的一部分,”罗森斯蒂尔学院海洋生物学和生态学博士生、这项研究的第一作者安东尼·博纳科尔塔 (Anthony Bonacolta) 说。
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