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密歇根大学和布朗大学的研究人员开发出一种新的计算方法来分析复杂的组织数据,这可能会改变我们目前对疾病的理解以及治疗方法。
综合和参考信息组织分割(IRIS)是一种新颖的机器学习和人工智能方法,使生物医学研究人员能够查看有关组织发育、疾病病理学和肿瘤组织的更精确的信息。
该研究结果发表在《自然方法》杂志上。
IRIS 利用空间分辨转录组学生成的数据,独特地利用单细胞 RNA 测序数据作为参考,同时检查多层组织,并以前所未有的精度和计算速度区分各个区域。
与传统技术不同,SRT 只能从组织样本中获取平均数据,它提供了更精细的视图,可以精确定位单个组织切片内的数千个位置。然而,密歇根大学公共卫生学院生物统计学教授、这项研究的资深作者周翔表示,挑战始终在于解释这一庞大而详细的数据集。
在解释大型复杂数据集时,IRIS 成为一个有用的工具——它的算法对数据进行分类,以识别和分割各种功能域,例如肿瘤区域,并提供有关细胞相互作用和疾病进展机制的见解。
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